2019年12月27日中共河北科技大学委员会校党字[2019]39文，设立中共河北科技大学澳联大信息工程学院直属支部委员会。学院下设党政办公室（综合事务部）、教学科研办公室（教学管理部）、团委（学生工作部）。

按照中外合作办学章程规定，学院管理机构为联合管理委员会，由九名委员构成，澳方4名，中方5名，负责学院运行和事务决策。管理委员会聘任中方正副院长各1名、澳方副院长1名。

学术委员会是学院教学科研工作的监督和评估组织，在联合管理委员会领导下工作。